Образцы для анализа

Выберите образец или образцы для анализа.

Genomenal поддерживает файлы образцов в форматах FASTQ, BAM, VCF, TXT, TSV:

1. Файл(ы) с прочтениями в формате FASTQ, полученные в результате секвенирования. В данном случае образец - это либо один файл (в случае секвенирования одиночных прочтений), либо пара файлов (в случае секвенирования парных прочтений).
2. Файл с аннотацией вариантов в формате VCF.
3. Файл с последовательностями, выровненными на референсный геном, в формате BAM.
4. Файл с данными генотипирования в формате TXT, TSV.

На заметку

Genomenal умеет распознавать заархивированные файлы (GZIP, ZIP, BZIP2, 7-ZIP, XZ, WIM, RAR).

Совет

Если у вас пара образцов опухоль/контроль, используйте файлы в форматах FASTQ или BAM.

Совет

Если целью вашего анализа является выявление вариаций числа копий (CNV), используйте файлы форматов FASTQ или BAM.