Перейти к основному содержимому

Пример образца с низким качеством данных

Если данные образца низкого качества, то одна из стадий пайплайна завершится с ошибкой (в статусе стоит красный значок ). Например, у данного образца задача “Оценка количества или глубины прочтений” завершилась с ошибкой, поскольку образец имеет очень низкое покрытие. Если данные низкого качества, анализ CNV не будет проведен, отчёт по CNV не построится.

На вкладке “Отчёт по CNV” на странице пациента можно увидеть вердикт по качеству данных образца в колонке “Особые отметки”. В данном случае “анализ не проведен, программная ошибка”: