Отчёт по CNV

Отчёт по CNV - это отчёт по результатам анализа числа копий хромосом в исследованном образце или образцах пациента. Если соблюдены все условия построения отчёта (см. ниже), в результате анализа формируется два отчёта - отчёт для образца и отчёт для пациента.

Условия построения отчёта по CNV#

Отчёт по CNV строится для образца, если выполняются следующие условия:

Образец загружен как образец неопухолевой ткани (образцов, имеющих тип "NORMAL") в формате FASTQ или BAM.
Анализ образца успешно завершился (то есть все стадии анализа имеют статус "Завершено"). Если анализ завершился с ошибкой, то в "Отчёте по CNV" для пациента будет соответствующее сообщение для образца, а "Отчёт по CNV" для образца не построится.
Для образца успешно завершилась стадия "Выявление вариации числа копий". Если стадия завершилась с ошибкой, то в "Отчёте по CNV" для пациента будет соответствующее сообщение для образца, а "Отчёт по CNV" для образца не построится. Если стадия исключена из анализа, то отчёт для образца не построится, а в отчёте для пациента образец упомянут не будет. Если стадия выключена у всех образцов пациента, то "Отчёт по CNV" для пациента не построится.
Шаблон отчёта активен (регулируется на странице "Шаблоны отчётов").
Шаблон отчёта был добавлен раньше, чем был обработан образец.

На заметку

Если у вас нет добавленного шаблона "Отчёт по CNV" и он вам необходим для анализа, вы можете обратиться к администратору или добавить его самостоятельно, как описано здесь.