Анализ покрытия

Покрытие генома (или целевых участков для экзома или таргетной панели) позволяет оценить, насколько информативен анализ в целом. В этом разделе можно оценить как долю покрытых участков в целом, так и то, насколько покрыты интересующие вас гены и транскрипты.

Глубина покрытия целевых участков (пример)

График показывает, какая фракция генома или целевых участков покрыта с различной глубиной. Так, в примере 30-ю прочтениями покрыто 94.39% целевых участков, что является хорошим показателем. Для более точной оценки покрытия в интересующих вас генах ниже на странице вы можете воспользоваться поиском и выбрать транскрипт. Для выбора транскрипта нажмите на название гена. По умолчанию указывается канонический транскрипт базы MANE Clinical, при отсутствии гена в базе указывается канонический транскрипт по аннотации VEP Ensembl. Результаты поиска могут быть экспортированы в виде таблицы.

Покрытие в гене TP53