Отчёт по CNV

Отчёт по CNV - это отчёт по результатам анализа числа копий хромосом в исследованном образце или образцах пациента. Если соблюдены все условия построения отчёта (см. ниже), в результате анализа формируется два отчёта - отчёт для образца и отчёт для пациента.

Условия построения отчёта по CNV#

Отчёт по CNV строится для образца, если выполняются следующие условия:

Образец загружен как образец неопухолевой ткани (образец, имеющий тип "NORMAL") в формате FASTQ или BAM.
Анализ образца успешно завершился (то есть все стадии анализа имеют статус "Завершено"). Если анализ завершился с ошибкой, то в "Отчёте по CNV" для пациента будет соответствующее сообщение для образца, а "Отчёт по CNV" для образца не построится.
Для образца успешно завершилась стадия "Выявление вариации числа копий". Если стадия завершилась с ошибкой, то в "Отчёте по CNV" для пациента будет соответствующее сообщение для образца, а "Отчёт по CNV" для образца не построится. Если стадия исключена из анализа, то отчёт для образца не построится, а в отчёте для пациента образец упомянут не будет. Если стадия выключена у всех образцов пациента, то "Отчёт по CNV" для пациента не построится.
Шаблон отчёта, включающий блоки "Герминальные CNV: результаты" и/или "Герминальные CNV: интерпретация", активен (регулируется на странице "Шаблоны отчётов").
Шаблон отчёта был добавлен в систему до того, как был обработан образец.

На заметку

Если у вас нет добавленного шаблона "Отчёт по CNV" и он вам необходим для анализа, вы можете обратиться к администратору или добавить его самостоятельно, как описано здесь.